במאמץ משותף של רשות נחל הקישון ומחלקת רשת ביוב וניקוז בעיריית חיפה בראשות יזיד אבו ראס, בוצע פרויקט להפרדת מי נחל סעדיה ממערכת הניקוז וניקוי הקרקעית המזוהמת מהתעלה המתחברת לנחל. תוואי הערוץ המקשר בין תעלת הניקוז לנחל, סבל שנים רבות מזיהום קרקע ומים, שהתבטאו בריחות קשים ובריכוזי שמן מינרלי גבוהים בקרקעית. במוצא הניקוז עמדו לאורך השנה מים עכורים המזהמים את נחל סעדיה המהווים מפגע סביבתי חמור. מבדיקות שערכה רשות נחל הקישון נמצאו קוליפורמים צואתיים, אמוניה וסולפיד יחד עם ריכוז חמצן מומס אפסי בנחל. הנתונים העידו על זיהום ישן מביוב ועל הזמן הארוך שהמים עומדים בתעלה.